«Существует огромное количество геномных данных как о шизофрении, так и о ревматоидном артрите. Их анализ вместе с известной информацией о взаимодействии белков может дать неоценимые ключи к пониманию взаимосвязи между заболеваниями, а также пролить свет на их общие корни», — сказал Мадхави Ганапатхираджу, доктор философии. , доцент кафедры биомедицинской информатики Медицинской школы Университета Питтсбурга и старший автор исследования.Хотя шизофрения — это психическое заболевание неизвестного происхождения, а ревматоидный артрит — это аутоиммунное заболевание суставов, которое возникает в результате атаки иммунной системы организма на его собственные клетки, считается, что оба заболевания находятся под влиянием нескольких генетических факторов риска, измененных окружающей средой. .«Несколько предыдущих исследований указали на потенциальную обратную связь между распространенностью и риском этих двух расстройств, поэтому мы задались вопросом, могут ли существовать отдельные генетические варианты, которые могут иметь противоположное влияние на риск шизофрении и ревматоидного артрита», — сказал один из старших. автор Вишваджит Нимгаонкар, доктор медицины, профессор психиатрии Медицинской школы Питта и генетики человека в Высшей школе общественного здравоохранения Питта.
Сначала исследователи проанализировали две большие базы данных генетических вариантов, в значительной степени связанных либо с шизофренией, либо с ревматоидным артритом. Они идентифицировали 18 уникальных вариантов, также известных как однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), которые были расположены в HLA-области генома, в которой находятся гены, связанные с иммунной функцией.
Оказалось, что варианты связаны с различным риском шизофрении или ревматоидного артрита. Поскольку SNP были расположены около восьми известных генов в этой области, авторы предположили, что эти гены могут приводить к дисфункции как при шизофрении, так и при ревматоидном артрите. Белки, кодируемые двумя из этих восьми генов, HLA-B и HLA-C, присутствуют как в мозговых, так и в иммунных клетках.
Анализ белков, которые взаимодействуют с этими восемью генами, с использованием вычислительной модели, разработанной в прошлом году командой Ганапатираджу под названием High-Precision Protein Interaction Prediction, обнаружил более 25 сигнальных путей с белками, общими для передачи сигналов как ревматоидного артрита, так и шизофрении. Более того, некоторые из этих путей были связаны с функцией иммунной системы и воспалением.
Результаты обнадеживают, поскольку они подтверждают ассоциации области гена HLA и иммунной функции с шизофренией и ревматоидным артритом, которые были известны более четырех десятилетий назад, — сказал Ганапатираджу. Все больше данных также свидетельствует о том, что дисфункциональная иммунная система может играть роль в развитии шизофрении.
«Мы считаем, что исследовательское сообщество, изучающее эти два расстройства, найдет наши результаты чрезвычайно полезными», — сказал Нимгаонкар.Авторы отмечают, что исследование было сосредоточено только на SNP в известных областях генов, и другие механизмы, помимо тех, которые они описали, также могут способствовать заболеваниям.
Однако исследование значительно сузило список потенциальных генов для изучения взаимосвязи шизофрении и ревматоидного артрита. По словам исследователей, изучение функциональной значимости генов-кандидатов в клетках и тканях позволит лучше понять эти два расстройства.