Это первое исследование, в котором использовалось полногеномное секвенирование для оценки серии геномов 258 больных раком, чтобы улучшить способность диагностировать предрасполагающие к раку мутации. Исследование опубликовано в Интернете в журнале EBioMedicine.«Секвенирование всего генома — это новый генетический инструмент, который может определять больше последовательностей ДНК человека, чем когда-либо прежде.
Наши результаты показывают, что почти 90 процентов клинически идентифицированных мутаций были достоверно обнаружены и были обнаружены дополнительные мутации гена рака, которые вместе с уменьшением затраты, связанные с секвенированием всего генома, означают, что этот метод улучшит уход за пациентами, а также приведет к открытию новых генов рака », — сказала д-р Теодора Росс, профессор внутренней медицины и директор программы генетики рака Юго-Западного Университета штата Вашингтон.Врачи и консультанты-генетики в клинике онкологической генетики Юго-Западного штата Юго-Западный университет помогают пациентам оценить риск многих видов рака, включая рак почек, кожи, легких, груди, яичников, толстой кишки, эндокринной системы и рака простаты. Если обнаруживается известная генетическая предрасположенность к раку, доктор Росс и ее команда консультируют пациента о лучших способах обнаружения рака на ранней стадии или, что еще лучше, предотвращения его образования.Примерно от 5 до 10 процентов всех случаев рака вызваны известными наследственными мутациями генов.
Эти мутации передаются из поколения в поколение. Мутации в генах BRCA1 и BRCA2 являются наиболее частой причиной наследственного рака груди. Мутации гена BRCA наиболее известны из-за риска рака груди, но они также вызывают повышенный риск рака яичников, простаты, поджелудочной железы и других видов рака. Кроме того, существует множество различных генов, включая ATM, CDH1, CHEK2, PALB2, PTEN и TP53, которые связаны с повышенным риском рака груди, и исследователи постоянно открывают дополнительные гены, которые могут влиять на предрасположенность к раку.
В этом исследовании исследователи разработали новые методы анализа большого количества данных, полученных с помощью полногеномного секвенирования. В частности, команда доктора Росса разработала метод сравнения группы пациентов с мутациями BRCA1 или BRCA2 с группой пациентов без мутаций BRCA. Все ожидаемые мутации BRCA1 и BRCA2 были обнаружены в группе BRCA, при этом достоверно обнаружено не менее 88,6% мутаций. Напротив, в когорте без мутаций BRCA были обнаружены различные мутации гена рака.
«Результаты демонстрируют, что полногеномное секвенирование может обнаруживать новые мутации раковых генов у« загадочных »пациентов, не относящихся к BRCA, демонстрируя дополнительную ценность, которую полногеномное секвенирование приносит будущей онкологической клинике», — сказал д-р Росс, хотя необходимы дальнейшие исследования. чтобы иметь возможность интерпретировать точные клинические последствия обнаруженных мутаций.«Таинственные пациенты — это те, у кого в семье есть сильная семейная история рака, но после стандартного генетического тестирования генетический диагноз не ставится.
В нашем исследовании секвенирование позволило нам обнаружить новые мутации гена-кандидата на рак у загадочных пациентов», — сказал доктор Росс. имеет звание профессора Жанны Энн Плитт по исследованию рака груди и кафедру Х. Бен и Изабель Т. Дечерд по внутренней медицине в честь Генри М. Уинанса, старшего, доктора медицины.