С помощью этого метода можно определить основополагающие мутации, из которых возникла опухоль, а затем с помощью компьютерного программного обеспечения составить карту генеалогического древа рака.Ученые из Института исследований рака в Лондоне и Института Сэнгера Wellcome Trust использовали секвенирование ДНК, чтобы идентифицировать панель мутаций, присутствующих в тысячах раковых клеток у трех пациентов с лейкемией. Затем они протестировали сотни отдельных раковых клеток на каждую мутацию, чтобы определить их генетический отпечаток и поместить их в генеалогическое древо рака.
Исследование показало, что рак каждого пациента имеет свое родословное дерево с уникальной серией мутаций, способствующих их развитию.Полученные данные могут быть использованы для определения ключевых мутаций, которые возникают на ранней стадии развития опухолей, что позволит врачам более эффективно использовать целевые методы лечения.Исследование, опубликованное в журнале Genome Research, финансировалось Leukemia and Lymphoma Research, Фондом лейкемии Кея Кендалла, Институтом исследований рака (ICR) и Wellcome Trust.
Опухоли растут в процессе дарвиновской эволюции, когда раковые клетки развивают полезную мутацию, которая позволяет им выживать и размножаться, производя популяцию клеток, которые могут мутировать дальше.Секвенирование всего генома рака обеспечивает подсчет множества мутаций, которые накапливаются в нем, но может не определить, где мутации ответвились от эволюционного дерева, чтобы произвести отдельные субпопуляции клеток.
Целевые методы лечения рака предназначены для атаки молекул, образованных мутациями, но если целевая мутация происходит на эволюционной ветви, а не на стволе, лечение не удастся, поскольку другие ветви доминируют и распространяются устойчивые к лечению клетки.В новом методе использовалось программное обеспечение, чтобы отнести раковую клетку с наименьшим количеством мутаций к предковому клону и поместить ее в корень эволюционного генеалогического древа, а другие клоны расположить в виде ветвей над ним.