У пациентов с запущенным немелкоклеточным раком легкого (НМРЛ), проходящих лечение в Пеннс-АСС, мутации, обнаруженные при жидкостной биопсии (внеклеточная циркулирующая опухолевая ДНК (цтДНК), полученная из крови), очень похожи на мутации из биоптатов тканей, выявленные в тестах секвенирования следующего поколения. : EGRF, TP53 и ALK, и это лишь некоторые из них. Более того, в нескольких случаях жидкие биопсии фиксировали клинически значимые мутации, не обнаруженные в биопсиях тканей по мере прогрессирования болезни пациентов.
Эти данные дополняют растущее количество доказательств, подтверждающих использование жидкой биопсии, особенно когда образцы ткани отсутствуют или их трудно получить, как это часто бывает с раком легких и другими видами рака, которые метастазировали по всему телу. Около половины из 102 пациентов в этом исследовании не имели биопсийной ткани, подлежащей секвенированию, поэтому исследователи полагались на анализы крови для обнаружения мутаций. Кроме того, сейчас клиницисты наблюдают появление целевых мутаций резистентности в поздних стадиях НМРЛ по мере прогрессирования заболевания и изменения методов лечения.
По словам авторов, идти в ногу с такой эволюцией невозможно с традиционными биопсиями тканей, но гораздо более правдоподобно с серийными образцами крови.«Это представляет собой небольшую смену парадигмы», — сказала старший автор исследования Эрика Л. Карпентер, доктор философии, магистр делового администрирования, директор Лаборатории циркулирующих опухолевых материалов и доцент-исследователь Медицинской школы Перельмана в Университете Пенсильвании. «Результат секвенирования тканевой биопсии считается золотым стандартом, с которым сравнивают результат ctDNA. Наша работа предполагает, что можно воздействовать на результат ctDNA, даже в отсутствие так называемого золотого стандарта, и получить клинический ответ через этим пациентам.
Это также дает преимущество тестирования без дискомфорта для пациента и возможных рисков, связанных с инвазивной биопсией ».Важно отметить, что исследование направлено на неотложную, неудовлетворенную потребность, сформулированную в недавно выпущенном «Отчете группы экспертов по исследованию рака Moonshot Blue Ribbon 2016», в котором содержится призыв приложить дополнительные усилия для разработки неинвазивных тестов для маркеров, включая цтДНК, чтобы ускорить обнаружение вируса. появление лекарственно-устойчивого заболевания. «Возможность точно предсказать, когда у пациента может развиться лекарственная устойчивость, может иметь серьезные последствия для выбора подходящего лечения рака для отдельных пациентов», — говорится в отчете, в котором отмечается 10 ключевых рекомендаций, выдвинутых членами группы Blue Ribbon, включая Чи Ван Данга. , Д.м.н., директор АСС.В исследование были включены 102 последовательных пациента с распространенным НМРЛ, пролеченных в Пенсильвании в период с февраля 2015 года по март 2016 года, которым были отправлены образцы крови для тестирования на цДНК в рамках их повседневной клинической помощи.
Большинство из них составляли женщины (68 процентов) с аденокарциномой (81 процент) и болезнью IV стадии (96 процентов), все с разными курсами лечения.Образцы жидкой биопсии были собраны у всех 102 пациентов и отправлены в Guardant Health в Калифорнии для геномного анализа; Использовалась панель 70 гена Guardant360. Образцы тканей удалось собрать только у 50 пациентов и впоследствии проанализировать в Центре персонализированной диагностики Пенна с помощью панели из 47 генов.
Среди 50 пациентов 41 мутация была обнаружена обоими методами, в то время как 24 терапевтически нацеленные мутации драйвера EGFR (известный драйвер заболевания легких) были обнаружены в образцах тканей и 19 — в образцах ктДНК. Важно отметить, что соответствие между двумя тестами было почти 100-процентным, когда образцы были получены одновременно, с увеличением несоответствия, когда образцы крови собирались через более длительные интервалы после образца ткани. Одно из объяснений этого может заключаться в том, что анализ крови может обнаруживать новые мутации, которые эволюционировали, чтобы противостоять лечению и, возможно, не были обнаружены во время первоначального исследования ткани.
Мутация устойчивости к EGFR T790M была идентифицирована в восьми жидких образцах и только в четырех образцах тканей.Серийные жидкостные биопсии были также выполнены у шести пациентов в рамках наблюдения за заболеванием, и во всех шести случаях результаты помогли принять клиническое решение, либо путем выявления причины или мутации устойчивости, поддающейся таргетной терапии, либо путем подтверждения того, что химиотерапия, вероятно, была наиболее эффективным методом лечения. лучший способ действий, когда образец ткани был невозможен.
Исследователи также описали историю болезни трех из этих пациентов, у которых ctDNA выявила появление терапевтически целевых вариантов в ходе их терапии. Один пациент поступил с метастатическим заболеванием при постановке диагноза, биопсия ткани не выявила вариантов EGFR, ALK или ROS1.
После направления к Penn тестирование ctDNA выявило транслокацию EML4-ALK и мутацию TP53, и пациент начал монотерапию кризотинибом со значительным улучшением симптомов. Через два месяца после терапии повторный тест ctDNA показал снижение EML4-ALK, а мутация TP53 не была обнаружена, что коррелировало с симптоматическим и рентгенологическим улучшением.
У двух других пациентов были похожие истории успеха.Чтобы лучше понять потенциальную клиническую эффективность секвенирования ктДНК следующего поколения, все обнаруженные мутации также были сопоставлены с доступными, одобренными Управлением по контролю за продуктами и лекарствами США (FDA), не по назначению или исследовательскими методами лечения.
Было установлено, что для большинства пациентов (70 процентов) доступно соответствующее клиническое исследование, 56 (55 процентов) пациентов получали таргетную терапию не по назначению, которую потенциально можно было бы использовать, и 32 (31 процент) пациентов получали терапию, одобренную FDA. доступны им для нацеливания на обнаруженную мутацию.Взятые вместе, эти данные предполагают, что жидкие биопсии для пациентов с НМРЛ могут давать результаты с высокой клинической значимостью, включая обнаружение терапевтически нацеленных мутаций в EGFR, ALK и других генах.
По словам авторов, это крупнейшее исследование такого рода, в котором используется клинический анализ для наблюдения за пациентами с НМРЛ. Он также впервые демонстрирует клиническую применимость неинвазивных анализов крови у пациентов, у которых анализ тканей невозможен.Следующим шагом является оценка полезности жидкой биопсии при диагностике в качестве дополнения к тестированию тканей и в контексте генетически гетерогенного метастатического заболевания. Здесь исследователи сообщили о серийном тестировании ctDNA для шести пациентов, но указали, что потребуются более масштабные исследования для дальнейшей оценки мониторинга ctDNA для выбора лечения, включая пациентов, у которых не обнаружены терапевтически целевые мутации и которые могут быть кандидатами на ингибиторы контрольных точек.
«Постоянно растущее число целевых методов лечения пациентов с раком легких сопровождается необходимостью диагностики с обнаружением в реальном времени терапевтически целевых мутаций», — сказал соавтор Кори Дж. Лангер, доктор медицины, профессор гематологии / онкологии и директор программы торакальной онкологии в онкологическом центре Penn’s Abramson Cancer Center и лечащий врач, участвующий в исследовании. «Все больше и больше жидких биопсий помогают удовлетворить эту потребность. Хотя образцы тканей, вероятно, останутся основной частью начального диагностического процесса, этот неинвазивный подход, по-видимому, является еще одним мощным инструментом в нашем наборе инструментов, который поможет определить лучший курс лечения больных раком легких ».