«Когда происходит вспышка патогенной кишечной палочки человека, своевременное реагирование очень важно», — сказал он. «Обычно сначала нет информации о том, откуда возникла болезнь».Эппингер, член Центра новых инфекционных заболеваний Южного Техаса, UTSA, называет метод, который он разработал в UTSA, формой полногеномного типирования последовательностей штаммов вспышек.
По словам исследователя, каждая вспышка имеет уникальные характеристики. Штаммы, вызываемые вспышками, имеют тонкие черты, которые делают их отличными от других штаммов, что позволяет Эппингеру сравнивать и противопоставлять их другим вспышкам.
Он сравнивает расследование с просмотром парковки, заполненной той же синей машиной. Все они выглядят очень похоже, но Эппингер ищет мельчайшие отличия, такие как вмятина, царапина или сломанный задний фонарь.«Никакая деталь не является слишком мелкой», — сказал он. «Мы можем использовать эти различия, чтобы отследить вспышку до ее зараженного источника, посмотрев, существовали ли эти признаки в других зарегистрированных вспышках того же патогена».Обнаружение сходства между вспышками позволяет проследить патоген до определенной страны или региона или даже до определенного места.
Чем быстрее следователи найдут источник вспышки, тем быстрее они смогут сдержать вспышку.Стратегии Эппингера также могут помочь определить, насколько смертельным может быть патоген. В своем исследовании он сосредоточился на вспышках кишечной палочки, которая недавно поразила такие рестораны, как Chipotle, и такие компании, как Totino’s, которые продают замороженную пиццу.«Некоторые вспышки могут быть более серьезными, чем другие», — сказал он. «В результате вспышки 2006 года, которая распространилась через шпинат, почти половина пострадавших были госпитализированы, а у значительной части было необратимое повреждение почек».
Изучая штаммы из различных прошлых вспышек кишечной палочки с помощью своих методов, Эппингер может измерить количество токсина, вырабатываемого каждым штаммом, который является прямым медиатором заболевания и показывает, насколько серьезным может быть заболевание.«Что касается расследования вспышки, вы можете спросить человека, где они ели, где работают и путешествовали ли недавно», — сказал Эппингер. «Если мы получим штамм вспышки, мы можем сопоставить его напрямую с другими штаммами вспышки и точно определить происхождение.
Ответ кроется в этих крошечных деталях».