Последняя часть этого исследования опубликована в февральском выпуске журнала PLoS Pathogens, в котором раскрыто, как белок клеток, захваченных вирусом герпеса, принимает структуру, подобную спагетти.Исследование дает первое в истории молекулярное понимание того, как РНК вируса герпеса, тип молекулы, который помогает расшифровать общий план вируса, передается между вирусными и клеточными белками, тем самым помогая вирусу захватить клетку. Доктор Танниклифф, первый автор статьи, сказал: «Вирусы не могут выжить или размножаться сами по себе — для этого им нужны ресурсы и аппарат в клетке-хозяине».В своих исследованиях, финансируемых Исследовательским советом по биотехнологии и биологическим наукам, исследовательская группа разработала и использовала новую методологию, которая показала, как именно гибкие белки взаимодействуют вместе и с РНК.
Д-р Танниклифф продолжает: «Мы разработали новую технику, которая показывает, как гибкие молекулы работают вместе; это позволило нам увидеть, как вирус может нарушить работу клетки, которую он заражает».Исследовательская группа использовала ЯМР — метод, родственный тому, который используется в сканерах тела МРТ и способный визуализировать молекулы в мельчайших масштабах, — чтобы изучить, как небольшие компоненты вируса герпеса помогают ему размножаться, связываясь с другими большими молекулами. ; это позволило получить изображения белка вируса герпеса обезьян, взаимодействующего с клеточным белком мыши и вирусной РНК.
Эти изображения затем были использованы для разработки трехмерной модели того, как вирусная РНК распознается этим белком вируса герпеса и затем передается клеточному белку хозяина.Хотя в исследуемой здесь модельной системе использовался белок из одного вида вируса герпеса, который передается только между беличьими обезьянами, не причиняя им большого вреда, эти вирусы герпеса обезьян структурно очень похожи на вирусы, вызывающие саркому Капоши у людей. Понимание того, как работают обезьяньи вирусы, может помочь найти способы предотвратить этот тип рака у людей.Старший научный сотрудник д-р Александр Голованов из Манчестерского института биотехнологии и факультета наук о жизни сказал: «Первоначально считалось, что белки взаимодействуют только как подходящие твердые тела — например, как замок и ключ.
Соответствующий ключ вставляется в замок, и это приводит в действие жесткий механизм замка. Затем понимание эволюционировало — было обнаружено, что не все белковые «ключи» жесткие, некоторые больше похожи на вареные спагетти, которые все еще могут успешно управлять жестким замком, регулируя его форма ".Доктор Голованов продолжает: «Совсем недавно были открыты« нечеткие »белковые комплексы — как будто не только« ключ »сделан из гибких вареных спагетти, но и части самого замка сделаны из вареных спагетти. Это».
Механизм спагетти «по-прежнему выполняет определенную сложную функцию, несмотря на недостаточную жесткость. Вирусные белки ведут себя во многом как такие спагетти».Он добавил: «К сожалению, в настоящее время не существует эффективного противовирусного лечения, которое бы достаточно эффективно подавляло репликацию вируса. Таким образом, обнаружение слабого места в вирусе, которое можно использовать для предотвращения саркомы Капоши в будущем, станет значительным прорывом».
Профессор Мелани Велхэм, исполнительный директор по науке BBSRC, сказала: «Это интересный метод, который поможет нам больше узнать о вирусе герпеса и может быть применен в вирусологических исследованиях в более общем плане. Это вид превосходных биологических исследований, лежащих в основе здоровья, которые BBSRC стремится финансировать предоставление социальных и экономических выгод для всех ".