«Впервые мы знаем, что нужно, чтобы нарисовать полную геномную картину рака человека», — сказал директор-основатель Broad Institute Эрик Ландер, старший соавтор статьи. «Это невероятно интересно, потому что знание генов и их путей выявит новые потенциальные мишени для лекарств и поможет проложить путь к эффективной комбинированной терапии».За последние 30 лет ученые нашли доказательства примерно 135 генов, которые играют причинную роль в одном или нескольких из 21 типа опухолей, проанализированных в исследовании. Новый отчет не только подтверждает эти гены, но и одним махом увеличивает каталог генов рака на четверть.
Он раскрывает 33 гена с биологической ролью в гибели клеток, росте клеток, стабильности генома, уклонении от иммунитета, а также в других процессах. Результаты исследователей публикуются в выпуске журнала Nature на этой неделе.«Один из фундаментальных вопросов, которые мы должны задать себе: есть ли у нас полная картина? Анализ геномов рака говорит нам, что ответ отрицательный: есть еще другие гены рака, которые предстоит открыть», — сказал первый автор статьи.
Майк Лоуренс, вычислительный биолог из Университета Брод.«Мы могли сказать, что наши текущие знания были неполными, потому что мы открыли много новых генов рака», — сказал соавтор исследования Гэд Гетц, директор группы вычислительного анализа генома рака Института Броуда и ассоциированный член Броуд. Гетц также является директором программы биоинформатики онкологического центра Массачусетской больницы общего профиля и отделения патологии. «Более того, мы можем сказать, что есть еще много генов, которые еще предстоит открыть, если измерить, как количество открытий генов растет по мере того, как мы увеличиваем количество образцов в нашем анализе. Кривая все еще идет вверх!»
По оценкам исследователей, им нужно будет проанализировать в среднем около 2000 образцов каждого типа рака, чтобы каталогизировать подавляющее большинство этих мутаций — наши около 100000 образцов примерно для 50 типов опухолей. «Учитывая, что во всем мире около 32 миллионов человек живут с раком, это очень разумное число для изучения», — сказал Гетц.Проанализированные типы опухолей включали те, в которых происходит много мутаций, таких как меланома и формы рака легких, и те, которые имеют гораздо более низкую частоту мутаций, такие как рабдоидная и медуллобластома, оба рака у детей.
В общей сложности исследователи проанализировали геномы почти 5000 образцов рака, сравнив их с подобранными образцами из нормальной ткани. Используя методы, которые группа впервые разработала за последние несколько лет, они заново открыли почти все ранее известные гены-драйверы рака для этих типов рака, подтвердив свой подход.Измененные гены, которые определила команда, необходимо будет изучить, чтобы определить, какие из них, если таковые имеются, могут стать важными мишенями для разработки лекарств.
Инициативы Института Броуда, такие как Target Accelerator в программе по борьбе с раком, предназначены именно для этого. Между тем, новая работа предлагает более широкий взгляд на вселенную геномики рака и заманчивые подсказки о том, что еще предстоит открыть, если будет проанализировано больше образцов.