«SNP обычно имеют два аллеля: минорный (с популяционной частотой 50%)», — сказал Горлов, первый автор статьи. "Что касается болезни, аллели можно разделить на группы риска и защитные. Мы исследовали, была ли доля связанных с риском аллелей выше среди минорных аллелей, и обнаружили, что отбор против аллелей риска снижает их частоту. Из-за этого аллели риска чрезмерно представлены среди минорных аллелей."
Чтобы продолжить свое исследование, команда использовала индекс окружающей среды / образа жизни (ELI), чтобы разделить болезни на две группы: зависящие от окружающей среды / образа жизни (E / LS) и независимые от E / LS.
В первую группу входят такие заболевания, как диабет 2 типа и сердечно-сосудистые заболевания, заболеваемость которыми связана с недавними изменениями в окружающей человека среде и образе жизни. Во вторую группу вошли заболевания, у которых нет или мало доказательств того, что их частота зависит от окружающей среды и образа жизни. Они обнаружили, что распределение аллелей риска для E / LS-зависимых заболеваний следует нейтральной модели, в то время как есть четкие доказательства отрицательного отбора для E / LS-зависимых заболеваний.
«Мы предположили, что изменения в окружающей среде и образе жизни меняют функциональную значимость существующих полиморфизмов, превращая некоторые из них в связанные с риском, а другие — в защитные от болезней», — сказал Горлов. "Поскольку абсолютное большинство существующих полиморфизмов избирательно нейтральны, частотное распределение SNP, связанных с заболеванием, следует нейтральной модели. Для снижения частоты аллелей, связанных с риском, требуется несколько поколений для отбора, что приведет к их чрезмерной представленности среди второстепенных вариантов, как мы наблюдаем для независимых от E / LS заболеваний."
Болезни человека, вызывающие наибольшее общественное бремя, являются заболеваниями, зависимыми от E / LS, и команда обнаружила, что аллельные распределения для них соответствуют распределению аллелей для среднего SNP человека, который является нейтральным.
Это позволит им оценить процент наследуемости, который можно объяснить всеми связанными с заболеванием SNP. Оценка общего вклада SNP в наследуемость болезни позволит определить, существуют ли другие важные источники наследственного риска.
Следующим шагом Горлова и его команды является применение нейтральной модели для оценки общей наследуемости выявленных E / LS заболеваний, относящихся ко всем связанным с заболеванием SNPS, включая те, которые еще не обнаружены. Эти результаты также помогут исследователям понять этиологию общих сложных заболеваний, потому что мы можем ожидать, что более функционально значимые варианты будут влиять на болезни с более сильным экологическим компонентом, в то время как необычные варианты могут быть более важными для болезней со слабым влиянием окружающей среды.