Для исследования, которое было опубликовано в Nature Communications, группа выполнила полное геномное секвенирование 30 отдельных опухолей, классифицированных как рак печени, проявляющих билиарный фенотип. Этот тип рака возникает в печени, но отличается от гепатоцеллюлярной карциномы, доминирующей формы первичного рака печени, и, как правило, более агрессивен и имеет худший прогноз. Они сравнили данные с 60 наиболее распространенными опухолями гепатоцеллюлярной карциномы.
Чтобы изучить экспрессию генов, они затем изучили данные секвенирования РНК от 25 видов рака билиарного фенотипа и 44 гепатоцеллюлярных видов рака.К удивлению, они обнаружили, что, хотя паттерны экспрессии генов — как показывает секвенирование РНК — различались между гепатоцеллюлярными карциномами и раками печени с билиарным фенотипом и зависели от гистологического типа, общий паттерн мутаций в клетках на самом деле был аналогичные опухоли любого типа, которые возникли у пациентов, перенесших инфекции гепатита C или B, и разные у пациентов без таких инфекций. Такой же тип кластеризации также встречается при раковых заболеваниях с хорошо изученной этиологией, таких как меланома (ультрафиолетовый свет) и рак легких (курение).
По словам Хидеваки Накагавы из Центра интегративных медицинских наук RIKEN, возглавлявшего команду: «Это интересное открытие, которое может указывать на то, что рак — даже различных гистологических типов — у пациентов с инфекциями гепатита может происходить из аналогичных клеток. , возможно, клетки-предшественники печени. У пациентов без гепатита мы не обнаружили каких-либо кластеров, и это указывает на то, что их рак может иметь совершенно другое клеточное происхождение ».Благодаря анализу исследователи также смогли выявить изменения в мутациях, которые связаны с более агрессивным раком печени желчного типа. В частности, они обнаружили, что мутации KRAS и IDH, которые связаны с более агрессивным раком, реже встречаются при раке у пациентов с хроническим гепатитом.
Заглядывая в будущее, Накагава добавляет: «Благодаря нашему анализу мы смогли идентифицировать некоторые виды рака печени с билиарным фенотипом, которые ближе к раку печени, и другие, которые похожи на рак желчных протоков. Мы надеемся, что в будущем это позволит мы создадим терапию, адаптированную для каждого типа. Мы также надеемся, что новые мутации, которые мы обнаружили, могут быть использованы в качестве мишеней для будущих терапевтических средств ».